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HCC MRIImagerieAnnotationJeu de données

L ' ensemble de données d ' imagerie multiséquences pour les carcinomes hépatoculaires, contenant 52 800 images DICOM et l ' étiquette du médecin, s ' applique à la formation à l ' image médicale en IA et au diagnostic clinique.

Aperçu des données

Nom de l'ensemble de donnéesEnsemble de données d'intégration d'images multiséquences HCC IRM
Volume total des données52 800 cas (avec une image notée 3,17 millions d'images)
Format des donnéesDICOM 3.0 / NifTI / JSON étiquette
序列类型T1WI / T2WI / DWI / ADC / DCE amélioration multi-étapes
Source des donnéesUnité de radiologie de l ' établissement médical coopératif (multicentres, équipements multiples, autorisation éthique)
Annotation MethodMarque indépendante de 2 radiologistes + 1 médecin en chef arbitre
隐私保护DICOM Information de la tête Désensibilisation, caractérisation faciale, HIPAA/RGPD
Update FrequencyAugmentations trimestrielles, augmentation moyenne annuelle de 8 000 à 12 000

Description détaillée des dimensions des données

Field NameType de donnéesValue Range / Description
patient_idString(32)ID, format: P{center}{seq}
study_uidString(64)DICOM Histoire Information UID
age_groupEnum18-30 / 31-45 / 46-60 / 61-75 / 76+
genderEnumM / F
sequence_typeEnumT1WI | T2WI | DWI | ADC | DCE_ART | DCE_PVP | DCE_DELAY
slice_thicknessFloat1.0 - 8.0 mm
pixel_spacingArray[2][x_spacing, y_spacing] mm
matrix_sizeArray[2][256-1024, 256-1024]
lesion_labelEnumHCC | ICC | MET | HEM | FNH | CYST | NORMAL
li_radsEnumLR-1 | LR-2 | LR-3 | LR-4 | LR-5 | LR-M | LR-TIV
lesion_sizeObject{long_axis_mm, short_axis_mm, volume_ml}
segmentationArrayCoordonnées du sommet polygone (coordonnées physiques, mm)
seg_mask_pathStringSplit le chemin relatif du fichier de masque NiffTI
b_valueInteger0 / 50 / 400 / 800 / 1000 (séquence de l'IBD)
annotator_consensusFloatCoefficient de dés entre les étiquettes : 0,0 - 1,0
qc_statusEnumPASS | FLAGGED | REJECTED

Échantillon de données JSON non identifié

[ { "patient_id": "P01A003824", "study_uid": "1.2.840.113619.x.masked.240518.001", "age_group": "46-60", "gender": "M", "sequence_type": "DCE_ART", "slice_thickness": 3.0, "pixel_spacing": [0.68, 0.68], "matrix_size": [512, 512], "lesion_label": "HCC", "li_rads": "LR-5", "lesion_size": {"long_axis_mm": 42.3, "short_axis_mm": 28.7, "volume_ml": 18.2}, "segmentation": [[125.3, 210.7], [130.1, 215.2], [128.9, 220.8], [120.5, 218.4], [118.2, 212.0]], "seg_mask_path": "masks/P01A003824_DCE_ART_HCC.nii.gz", "annotator_consensus": 0.92, "qc_status": "PASS" }, { "patient_id": "P02B015637", "study_uid": "1.2.840.113619.x.masked.240312.002", "age_group": "31-45", "gender": "F", "sequence_type": "T2WI", "slice_thickness": 5.0, "pixel_spacing": [0.94, 0.94], "matrix_size": [384, 384], "lesion_label": "HEM", "li_rads": "LR-1", "lesion_size": {"long_axis_mm": 12.1, "short_axis_mm": 8.5, "volume_ml": 0.46}, "segmentation": [[340.5, 155.2], [345.8, 158.0], [343.1, 162.7], [338.2, 160.1]], "seg_mask_path": "masks/P02B015637_T2WI_HEM.nii.gz", "annotator_consensus": 0.88, "qc_status": "PASS" }, { "patient_id": "P03C027419", "study_uid": "1.2.840.113619.x.masked.240115.003", "age_group": "61-75", "gender": "M", "sequence_type": "DWI", "slice_thickness": 5.0, "pixel_spacing": [1.17, 1.17], "matrix_size": [256, 256], "b_value": 800, "lesion_label": "ICC", "li_rads": "LR-M", "lesion_size": {"long_axis_mm": 55.8, "short_axis_mm": 41.2, "volume_ml": 49.6}, "segmentation": [[89.2, 78.4], [95.6, 82.1], [94.8, 88.7], [87.3, 91.5], [82.1, 85.2]], "seg_mask_path": "masks/P03C027419_DWI_ICC.nii.gz", "annotator_consensus": 0.95, "qc_status": "PASS" }, { "patient_id": "P01A003825", "study_uid": "1.2.840.113619.x.masked.240518.004", "age_group": "46-60", "gender": "M", "sequence_type": "DCE_PVP", "slice_thickness": 3.0, "pixel_spacing": [0.68, 0.68], "matrix_size": [512, 512], "lesion_label": "HCC", "li_rads": "LR-5", "lesion_size": {"long_axis_mm": 40.1, "short_axis_mm": 26.9, "volume_ml": 15.2}, "segmentation": [[122.0, 208.1], [127.1, 213.0], [126.3, 218.2], [118.0, 216.0], [115.5, 209.8]], "seg_mask_path": "masks/P01A003825_DCE_PVP_HCC.nii.gz", "annotator_consensus": 0.93, "qc_status": "PASS" }, { "patient_id": "P04D008992", "study_uid": "1.2.840.113619.x.masked.240707.005", "age_group": "76+", "gender": "F", "sequence_type": "DCE_DELAY", "slice_thickness": 4.0, "pixel_spacing": [0.82, 0.82], "matrix_size": [480, 480], "lesion_label": "NORMAL", "li_rads": "LR-1", "lesion_size": null, "segmentation": null, "seg_mask_path": null, "annotator_consensus": null, "qc_status": "PASS" } ]

标注规范与质量控制

标注标准

  • Classification de la maladie par le diagnostic de la maladie suivant les critères de diagnostic LI-RADS v2018
  • Divulguer l'étiquette en utilisant une couche de 1 mm par couche, valeurs interpolées lisses
  • L'alignement multi-séries est basé sur la période d'artère améliorée T1WI, la rigidité + alignement d'imitation, mesures mi-like
  • Outil d'intégration : ITK-SNAP / Slicer 3D, sortie uniforme au format NNFTI

质控流程(三级质检)

  • 一级自检:Après que le médecin ait fait la marque, il vérifie tous les cas et corrige l'erreur évidente.
  • 二级互检:Un autre médecin de pairs a recoupé, Dice & lt; 0.80 a renvoyé le post.
  • Contrôles d'experts de troisième niveau:Le médecin en chef extrait au hasard 15 % du nombre total de cas, taux global uniforme ?? 0,90.
  • Cohérence de l'étiquette :Classification des LIR-RADS Coefficient Kappa 0,85

质量指标

99.2%

数据完整率

0.92

Coefficient moyen des dés

0.87

LI-RADS Kappa

<1.5%

退标率

AI Training Use Cases

Test et classification de l'hépatite

Modèle d'application: NU-Net / YOLOV8-3D / SwinUNETR / MONAI. Un dépistage d'image à plusieurs séquences de calibrage des fourneaux et du modèle de classification automatique LI-RADS, FROC & g; 0,85 normes cliniques acceptables.

3D image médicale divisée

Modèle d'application : NU-Net / SegResNet / UNETR / MedSAM. Traduire des étiquettes polygonales en masque de carrosserie 3D pour fournir une formation sémantique de fractionnement à l'appui de plusieurs catégories (HCC/ICC/HEM, etc.).

alignement et intégration multiséries

Modèle d'application : VoxelMorph / TransMorph / LapirN. En utilisant les étiquettes, une formation dans un réseau déformable avec des données multi-séries est fournie, autospace aligne les différentes séries d'images IRM.

影像组学与预后预测

Modèles d'application: Radimitics (PyRadiomics)+XGBoost/ Random Forest. Extraire les fonctionnalités du groupe d'images 1000+D du masque de partition, construire des modèles tels que les prévisions de post-réactivation HCC, la classification de statut MVI, etc.

Get This Dataset

Les ensembles de données d'imagerie IRM de HCC fournissent des autorisations d'affaires, y compris des documents d'étiquetage complets et des images DICOM dissensoriées.

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